האגודה הוקמה בשנת 1887 בראשון לציון במטרה לסייע לפועלים שעבדו במושבה ובסביבתה. מטרות האגודה היו: חיפוש עבודה מאורגן עבור החברים, סיוע למחוסרי העבודה ולחולים, הפעלת מטבח ודיור משותף. האגודה פעלה לשמירת זכויותיהם של הפועלים החדשים, שהועסקו ברובם כשכירי יום, ותבעה ממעסיקיהם לסייע להם על-ידי יישובם בשטחי קרקע חדשים. 'אגודת הפועלים' הוקמה  בתקופת העליה הראשונה ופעלה זמן מועט.
עם מייסדיה ופעיליה של האגודה נמנו יחיאל מיכל הלפרין, אבא רומנוב, אברהם אייזנברג, יהודה גרזובסקי (גור) ויחזקאל דנין . לאחר 'מרד' איכרי ראשון לציון (1887) כנגד נציג הבארון רוטשילד, יהושוע אוסוביצקי נאסר על הקמתן של אגודות שלא נתאשרו בפאריס ופעילותה של האגודה במקום פסקה.