קיבוץ משגב עם הוקם בתחילה כהיאחזות
פלמ"ח על ידי
מחלקת נגבה - הכשרת גבעת השלושה (1943-1945). תחילתה של הכשרה זו בקבוצה של 13 נערים עובדים בוגרי תנועת '
הנוער העובד' מסניף תל-אביב ומסניפים נוספים אשר גויסו לפלמ"ח בדצמבר 1942. בתחילה הם הוצבו במחלקת בודדים בקיבוץ
נגבה, שם התגבשו וגייסו חברים נוספים, עד שמנין חברי הקבוצה הגיע ל-48 איש. בשנה השניה לשירותם הם הועברו ל
גבעת השלושה, וב-1 בינואר 1944 הכריזו על עצמם כהכשרה.
ב-2 בנובמבר 1945 (יום הצהרת בלפור) הקימו 19 מחברי ההכשרה את היאחזות משגב-עם בגליל העליון על גבול לבנון. המקום נועד ליישוב
חיילים ממשוחררי מלחמת העולם השניה, ומחלקת הפלמ"ח הייתה אמורה להחזיק בו
באופן זמני. חברי ההכשרה בחרו להתעלם מתנאי ההסכם שחתמו עם 'המרכז החקלאי'
וראו במקום את יישובם הקבוע.
בשנים הראשונות סבלו המתיישבים מתנאי האקלים הקשים, מקשיי נגישות, מניתוק מיישובים
אחרים, ממחסור במים, בקרקעות ובמשאבים. בשנת 1946 נבנו שני מבני הקבע הראשונים. במלחמת העצמאות היה הקיבוץ למשלט קדמי בגבול
לבנון, אשר מילא תפקיד מרכזי במערך הלחימה באזור והיה נתון במצור זמן ממושך.
בשנת 1951 הונח קו מים ממעין משגב אל המשק. בשנת 1955 נחנך כביש הגישה מצומת תל-חי. בשנות ה-60, בשל החמרה במצב הבטחוני בגבול, הוקמו גדר חשמלית ומגדלי שמירה. בשנת 1962 נחנך חדר האוכל. בשנת 1973 הוקם מפעל 'שיאון' לאריגה. בשנת 1980 נהרגו פעוט וחבר משק על ידי מחבלים שחדרו למשגב עם מגבול לבנון. בשנת 1983 עבר הקיבוץ ללינה משפחתית. בשנת 1997 החל הקיבוץ בתהליכים של הפרטה ושינוי אורחות החיים. כיום הקיבוץ מוגדר כ'קיבוץ מתחדש'.
בשנים הראשונות הצטרפו למייסדי הקיבוץ השלמות מהכשרות מגוייסות של הפלמ"ח: במאי 1947 הצטרפה הכשרת דפנה (1947-1945), באוקטובר 1948 חלק מחברי הכשרת חולתה 1947 (הכשרת 'משמר הירדן') ובשנת 1949 הכשרת שפיים (נוער עולה). המצטרפים היו בוגרי תנועת 'הנוער העובד' מסניפים שונים בארץ ובוגרי חברות
נוער עולה מבולגריה, רומניה, פולין, עיראק ועוד. במהלך השנים נקלטו בקיבוץחברו נוער ו גרעיני נח"ל נוספים, בעיקר מתנועת 'המחנות העולים'. בשל הקרבה לגבול ותנאי האקלים הקשים סבל היישוב מאז הקמתו
משיעור גבוה של עזיבות והתקשה להגדיל את מספר החברים. בשנת 2007 אוכלסה הרחבה קהילתית שנבנתה בכניסה לקיבוץ.
כיום ענפי המשק העיקריים בקיבוץ הם: חקלאות (גידולי שדה, מדגה, לול, כרם, מטעים, אבוקדו),
תעשיה (מפעל 'שיאון ביוטקסט מדיקל' למוצרי חבישה), תיירות ('אורחאן משגב
עם'), השכרת דירות ועסקים קטנים.