בשנת 1935 הוקם בסמוך לצומת מסמיה מושב עובדים. עם פרוץ מאורעות 1936 נעזב הישוב ונחרב.
ב-28 ביולי 1937, במסגרת התישבות 'חומה ומגדל', הוקם במקום בשנית מושב עובדים על ידי חברי 'ארגון מנחם', קבוצת פועלים ותיקים שהתארגנה ברחובות. באוקטובר 1939, בעקבות החלטה של המוסדות המיישבים, עזבו חברי 'ארגון מנחם' את המקום והקימו את כפר ורבורג.
בשנים 1931-1930 נוסד באזור וילנה, גרודנה וביאליסטוק שבפולין גרעין של 'השומר הצעיר' בשם 'כרית' (ראשי תיבות של 'כת רווקים יהיו תמיד'). בשנת 1932 נוסד באזור מלאבה שבפולין גרעין נוסף של 'השומר הצעיר' בשם 'הפועל'. בשנת 1932 התאחדו שני הגרעינים והגרעין המאוחד נקרא אף הוא 'כרית'. בשנים 1933-1932 עלו חברי גרעין 'כרית' לארץ ישראל, ובתחילה קיבלו הכשרה בקיבוץ מרחביה. בספטמבר 1932 עברו הם עברו לעבוד בפתח תקווה והתאכסנו שם אצל הקיבוץ הליטאי. באפריל 1933 הקימו קיבוץ עצמאי במושבה הדר שבשרון, שם שהו במשך שבע שנים.
בנובמבר 1935 החלו חברי קיבוץ עליה ב' מארצות הברית של 'השומר הצעיר' לעלות לארץ ישראל. בתחילה התרכזו העולים בעין שמר. באוקטובר 1936 הם התאחדו עם גרעין 'כרית' ועברו להדר. הגרעין המאוחד נקרא 'אמריקה-כרית'.
ב-6 בדצמבר 1939 נערך טקס העליה על הקרקע בגבעה שנעזבה על ידי 'ארגון מנחם'. הישוב נבנה במתכונת 'חומה ומגדל' (ומבנים אלה עמדו על תלם עד פברואר 1941). בתחילה התישבה במקום קבוצת חלוץ מחברי הקיבוץ. לאחר כשנה הוקם ישוב הקבע על גבעה סמוכה. תוך כשנה וחצי הושלמה העברת כל חברי הקיבוץ מהדר לנקודה החדשה. עם המעבר למקום הקבע שונה שם הישוב ל'כפר מנחם' על שמו של מנחם אוסישקין.
בשנת 1943 הצטרפו לכפר מנחם חברי קיבוץ 'אלגביש' מרעננה, יוצאי 'השומר הצעיר' מגרמניה וגליציה. בשנת 1946 נקלטה בקיבוץ חברת נוער א', הראשונה מבין מספר חברות נוער שהגיעו לקיבוץ במהלך השנים, חלקן נשארו בקיבוץ כהשלמה. בשנת 1947 נסלל כביש הגישה למשק. בשנת 1948 הצטרף לקיבוץ גרעין 'חרות' (בשנת 1949 עברו חלק מחבריו לשער הגולן). במהלך השנים נקלטו בקיבוץ בוגרי חברות נוער, משפחות ויחידים.
לפני קום המדינה היה בכפר מנחם בסיס של הפלמ"ח. מכפר מנחם יצאו ב-6 באוקטובר 1946 מייסדי היישוב קדמה, במסגרת מבצע העליה של י"א הישובים בנגב. לאחר מלחמת העצמאות נוספו לקיבוץ 9,000 דונם מאדמות הכפר הערבי אידניבה שננטש במהלך המלחמה. בשנת 1958 ניטע הפרדס הראשון. בשנת 1965 נפתח מפעל הקרמיקה.
בשנים האחרונות עבר הקיבוץ תהליכים של הפרטה ושינוי אורחות החיים. כיום מופעל בו מודל 'רשת ביטחון'. בקיבוץ נבנתה הרחבה קהילתית והוקמה אגודה מוניציפאלית בשם 'מתישבי כפר מנחם' המאגדת את תושבי הקיבוץ ותושבי ההרחבה. כיום ענפי המשק העיקריים בקיבוץ הם: תעשיה ('מפעל מתכת - כפר מנחם' המייצר
מוצרים לענף החשמל, 'קיר וחומר' מפעל ליצור קרמיקה אמנותית וקירות קרמיים,
מחצבת כורכר), חקלאות (לול, רפת, גדולי שדה, מטעי נשירים), שירותים
ועסקים קטנים.
